El equipo del Jeffersonian, el Dr. Clark Edison (la estrella invitada Eugene Byrd), Cam (Tamara Taylor), Brennan (Emily Deschanel) y Booth (David Boreanaz) investigan la muerte de la hija de una familia adinerada cuyos restos fueron encontrados en un parque nacional.

El equipo del Jeffersonian investiga la muerte de Brian Thomas, el entrenador de natación de un colegio comunitario, cuyos restos fueron encontrados tirados en el fondo de un pozo. Cuando los posibles sospechosos dicen a Brennan y Sweets que Brian podría haber tenido una aventura, el equipo trata de excavar en lo más profundo sólo para encontrar detalles de la vida secreta de Brian. Mientras tanto, Sweets releva a Booth en la investigación, mientras que éste se prepara para testificar ante un subcomité del Congreso y el equipo del Jeffersonian consigue un nuevo interno (la estrella invitada Laura Spencer), que llama la atención de Sweets.

Owen y Teddy tienen que lidiar con la llegada sorpresa de Megan Hunt, que no sabe nada sobre su situación. Catherine se prepara para su primera cirugía en un veterano de guerra que no está preparado emocionalmente para esta intervención. A Meredith le preocupa que DeLuca opere solo con Richard.

Amelia y Link viajan a Nueva York para operar a un paciente con una deformidad espinal severa, pero se encuentran con algo más, que no esperaban, cuando Nancy Shepherd los invita a cenar en su casa.

The kids are away for the summer, and the gang looks forward to their freedom; Angie obsesses over writing the world\'s longest email to her ex; Douglas inexplicably ghosts Poppy on their first date.

Will feels like everything is changing as Sophie returns home from camp a seemingly different person. Miggy gets a new temp job at Angie\'s law firm to help him earn more money to go toward Jack\'s preschool costs.

Los doctores del Chastain están rodeados de nuevas reglas y médicos, ya que Red Rock Mountain Medical se ha hecho cargo del hospital. Conrad se encuentra en una situación peligrosa cuando la construcción de un nuevo centro de neurocirugía provoca una explosión de gas en el hospital. Mientras, el nuevo neurocirujano de moda, Barrett Cain, se pone a prueba con una cirugía complicada y Mina actúa como un apoyo para Nic, que está luchando con una pérdida devastadora.

Durante seis semanas Booth ha estado reponiéndose de su operación y mientras Brennan ha estado en Guatemala y al regresar ha acudido a pasar un rato con la médium de Ángela. Brennan es escéptica pero Avalon Harmonia descubre la relación que tiene con Booth y que estaba embarazada en sus extraños sueños. Brennan se va de allí pero la médium habla con Angela de que va a pasar algo importante y le comenta que hay muchos cadáveres sepultados bajo una fuente. El doctor Lance Sweets le da el alta a Booth, lo cual le complace ya que está deseando comenzar a trabajar.

Cuando un estudiante es contaminado con un extraño y potente veneno, House y su equipo deciden averiguar qué es lo que está matando a los adolescentes. House envía a Cameron y Chase a la casa del estudiante en busca de una nueva droga que está seguro de que el joven consumía. No encuentran nada, pero cuando otro chico parece sufrir los mismos síntomas, empiezan a creer que pronto descubrirán la clave. Por otro lado, una paciente octagenaria a la que House ha atendido, parece haberse enamorado del doctor.

Un legendario músico de jazz llega al hospital con síntomas de padecer una esclerosis múltiple. La enfermedad le fue diagnosticada hace años, y ya no tiene esperazas ni ganas de seguir viviendo. El doctor House, un enamorado de su música, cree que su enfermedad no es ELA y que tiene algo que puede curarse, pero el músico ha firmado un documento, llamado RCP, en el que indica que no quiere que le reanimen si tiene una crisis. Gregory House, seguro de su instinto, ignora el documento y lucha por salvar la vida del músico.

El doctor Foreman cree que una mujer vagabunda finge una enfermedad para conseguir comida en el hospital universitario. Pero el doctor Wilson piensa que no finge y cree necesario tratarla. En este momento sus síntomas empeoran y el equipo debe estudiar qué le ocurre, pero tienen dificultad al no saber su identidad y no poder localizar el historial médico. Mientras tanto, House tiene que atender a dos estudiantes de medicina a pesar de su poco interés por la enseñanza.

La doctora Lisa Cuddy, directora del hospital, ha hecho una apuesta con House: si pasa una semana sin tomar sus pastillas para el dolor de la pierna, puede estar un mes sin la obligación de pasar consulta a los pacientes. House esta seguro de que puede superar el trámite, pero llega un caso al hospital que le pondrá contra las cuerdas. Un joven sufre hemorragias internas y un fuerte deterioro en el hígado. El doctor House y su equipo no aciertan con el diagnóstico del joven y cada vez les queda menos tiempo.

Hank Wiggen es una estrella del béisbol que está tratando de volver al deporte tras superar una adicción a la drogas. Durante un acto publicitario, uno de sus brazos se parte. Está sufriendo una extraña enfermedad que afecta a su cuerpo haciendo que los huesos sean sumamente débiles. El doctor House cree que la causa está en el consumo de drogas, pero las opciones y el tiempo se agotan y la vida del paciente corre serio peligro.

El equipo Jeffersonian descubre el cuerpo de un renombrado pero desagradable ajedrecista entre comida para cerdos. Durante la investigación, Sweets sorprende a sus compañeros con unas gran dotes para el ajedrez, lo que será de gran utilidad para encontrar al asesino. En cuanto a Cam, éste recibe un premio, pero duda en aceptarlo, ya que cree que Brennan lo merece más. Mientras tanto, el podólogo forense Dr. Douglas Filmore llega al Jeffersonian para ayudar a Brennan.

El equipo del Jeffersonian investiga el asesinato de Lauren Frank, víctima de un secuestro cuyos restos fueron encontrados enterrados en un parque. Pero cuando descubren la relación infeliz que Lauren tenía con su madrastra, el equipo comienza a pensar que el asesino era alguien cercano a la chica que lo esperado. Mientras tanto, Hodgins descubre un impactante secreto acerca de su familia y Brennan y Booth se enfrentan a un dilema común parejas - ya sea para colaborar mezclarse sus fondos

Booth y un agente de la CIA deben trabajar en conjunto para atrapar a un terrorista. Mientras tanto, Brennan quiere acercarse a Booth en el campo laboral, pero tendrá que enfrentarse a las implicaciones que esto conlleva a nivel familiar.

Durante la búsqueda de un asesino, el equipo de Jeffersonian encuentra pistas claves al ahondar en la vida pasada de la víctima. Por otro lado, un antropólogo forense cubano se incorpora al equipo para realizar prácticas y así poder completar su título académico.

Un actor de televisión infantil es encontrado muerto lo que lleva al equipo del Jeffersonian a investigar que fue lo que desencadenó la muerte del personaje infantil preferido de la televisión, “Zanahoria Bill.” Pero cuando el equipo descubre que el actor era conocido por su promiscuidad, empiezan a encontrar algunos sospechosos improbables. Mientras tanto, Booth y Brennan planean la primera fiesta de cumpleaños de Christine, y Clark (la estrella invitada Eugene Byrd) pide al equipo que le den su opinión sobre una novela de ficción que ha terminado.

Una pareja de enamorados ve truncada su felicidad cuando él es asesinado por un ladrón. La necesidad de salvar la vida a la chica hace que él permanezca en la Tierra en forma de fantasma, e intente advertirla del peligro que corre. Su único medio de comunicación es una alocada vidente.

Dos familias italianas, los Prestolani y los Montebello, tienen pizzerías rivales. Sin embargo, a pesar de las oposiciones patriarcales, sus hijos se enamoran.

En un pequeño pueblo llamado Benjamín ocurre un milagro: John Carey, el carpintero, consigue resucitar a un niño que había muerto ahogado. Tan solo con tocarlo, sin ningún tipo de explicación científica, John ha salvado una vida. Ahora deberá enfrentarse a la popularidad y sensacionalismo suscitado por la prensa al hacerse eco de la noticia.

La veterinaria Dra. Carly Monroe tiene la costumbre de pasar por el refugio local de perros tan a menudo como le es posible porque ama a los perros y ama en secreto al dueño del refugio, Dan. Desafortunadamente, el va a casarse con su glamurosa novia televisiva y mudarse a la Gran Manzana.

Jane Goodale, una joven que vive en Nueva York, está decidida a triunfar tanto en su profesión, contratando invitados para un popular programa de entrevistas, como en el amor. Cuando Ray Brown, el nuevo y apuesto ejecutivo del programa, empieza a tirarle los tejos, Jane se siente en la cima del mundo. Y en cuanto Ray pronuncia las palabras mágicas, la pareja decide compartir un acogedor nido amoroso. Pero cuando él, inexplicablemente, pone fin a tan fogoso romance, Jane se siente anonadada y perdida. Busca entonces obsesivamente una razón que explique el comportamiento de Ray, y cree haberla encontrado en el mundo animal. El descubrimiento de una extraña relación entre hombres y animales da lugar a una teoría que convierte a Jane en una reverenciada gurú del amor.

La película cuenta la historia de una mujer divorciada que comienza a tener una aventura sentimental con el joven que vive en la casa de al lado, que es un adolescente. Aunque al principio la relación marcha bien, pronto empieza a complicarse, haciéndose mucho más difícil de lo que ambos habían imaginado. Además, su affaire tendrá consecuencias negativas para los dos.

Durante seis semanas Booth ha estado reponiéndose de su operación y mientras Brennan ha estado en Guatemala y al regresar ha acudido a pasar un rato con la médium de Ángela. Brennan es escéptica pero Avalon Harmonia descubre la relación que tiene con Booth y que estaba embarazada en sus extraños sueños. Brennan se va de allí pero la médium habla con Angela de que va a pasar algo importante y le comenta que hay muchos cadáveres sepultados bajo una fuente. El doctor Lance Sweets le da el alta a Booth, lo cual le complace ya que está deseando comenzar a trabajar.

El libro de Brennan lleva doce semanas como número uno de las listas de más vendidos por lo que le han regalado un rolex con el que acude a trabajar. El nuevo caso en el que trabaja con Booth es el de un hombre al que asesinaron dos días antes por el contenido del maletín que llevaba. Al cadáver le fan cortado una mano para hacerse con el botín, ya que iba esposado al maletín, y le han pasado por encima con un coche. Varios gatos han comido parte del cadáver por lo que también han de estudiar sus excrementos.