Solicitan la ayuda del equipo de UAC al encontrar un extraño jeroglífico en la axila del cadaver de un mendigo que coincide con los encontrados en otras victimas unos años atrás. Mientras tanto, Reid decide sacar anticipadamente a su madre de un estudio clínico y llevársela a casa con él.

El equipo investigará la aparición de múltiples cuerpos masculinos demasiado dañados para ser identificados.

Un Oficial muere durante un entrenamiento y el Comandante Michael Raineier no deja de insistir en que ha sido un desafortunado accidente. Cuando el equipo de NCIS acude a la escena, descubre que el material que el joven y su compañero usaban era de aluminio, mientras el del resto de compañeros era de acero.

El equipo del FBI y Avery asisten a una gala organizada por su objetivo Hank Crawford con la esperanza de arrestarlo. Roman se acerca más a los Crawford.

El equipo se enfrenta una amenaza mortal, mientras que la lealtad de Román se pone a prueba.

Castle y Beckett investigan el asesinato de un hombre que encontraron accidentalmente entre la basura de un edificio y con aparentes signos de violencia. Pronto descubren que la víctima tenía una doble vida, estaba casado y con hijos y con una falsa identidad mantenía una relación con una compañera de trabajo. Esta doble vida sin duda complica la resolución del caso, ya que se multiplican los posibles asesinos. Y mientras tanto, Martha se prepara para el primer ensayo de su obra. Y Alexis comienza unas prácticas durante unos días en la comisaría. Y aunque el trabajo que mandan no resulta ser tan interesante como esperaba, tendrá que adaptarse.

Castle y Beckett investigan el asesinato de un marchante de arte al que han disparado en su propia galería. No hay videos de seguridad que muestren lo que ocurrió esa noche. La policía ha encontrado en el lugar de los hechos cinco casquillos, pero inexplicablemente sólo han localizado cuatro balas. La quinta bala desaparecida puede ser clave. Y por si esto fuera poco, el único testigo sufre amnesia. Con mucha paciencia y astucia intentarán que el testigo recobre la memoria. Mientras, buscan más pistas en el entorno cercano del galerista. Por otra parte, Martha sigue entusiasmada con sus avances en el manejo de la informática y con el reencuentro con Ched, su antiguo amigo del instituto, con el que contactó mediante la red social.

Castle y Beckett tienen que ir a una boda a investigar el asesinato de una de las damas de honor que ha aparecido asfixiada en una de las habitaciones del hotel. En esta ocasión Castle llegará tarde al lugar de los hechos y se sorprenderá al descubrir que la prometida, Kyra, fue su novia hace tiempo. Lo primero que hará el equipo de Beckett será interrogar a todos los invitados, ya que de momento son todos sospechosos. Según avanza la investigación, se descubrirán algunos secretos del novio que harán que Kyra se plantee si se va a casar con la persona adecuada. Esto también provocará que los sentimientos de Castle hacia Kyra vuelvan a renacer, lo que pondrán algo celosa a Beckett.

Una mujer aparece muerta en la bañera de un motel, sumergida en aceitte de motor. Castle y Beckett investigarán el asesinato y se darán cuenta de que la víctima no es quien decía ser y que está implicada en un atentado de hace veinte años. Mientras, el escritor y la agente de policía estrechan su amistad jugando regularmente al poker con otros amigos de ambos.

Beckett y Castle se encuentran una mañana de domingo ya que ha desaparecido una niña de dos años llamada Ángela Candela. No ha aparecido ningún cuerpo en la casa de sus padres donde estaba la niña mientras su padre pintaba pero el FBI ha pedido la colaboración de Beckett aunque a ella no le sienta bien que el agente al mando sea Will Sorenson. Sorenson era un agente destinado antes en Boston con el que Beckett había tenido una relación previa de seis meses tras conocerse al participar en un caso de un secuestro de un niño de seis años. Por las primeras investigaciones parece que el sospechoso entro por la ventana donde cogió a la niña, adoptada, que estaba desayunando delante de la tele mientras su madre dormía y su padre pintaba y posiblemente salió por la puerta de servicio. Poco después los padres reciben una llamada exigiendo 700.000 dólares.

Un cirujano plástico aparece asesinado de una peculiar forma en la parte de atrás de un coche. Beckett y Castle investigarán el caso y pronto se darán cuenta de que la mafia está implicada. Mientras, Castle continúa interesado en la muerte de la madre de Beckett y a pesar de las advertencias de su compañera, consulta a un forense para descubrir quien fue el culpable.

Durante la investigación de la muerte de un hombre relacionado con la mafia irlandesa, Castle y Beckett descubrirán que este asesinato podría tener alguna relación con la muerte de la madre de Kate. En esta ocasión, la similitud de las heridas con otros cinco asesinatos será la clave para que Lanie, la médico forense, tenga claro que se trata del mismo asesino. Seguramente sea un peligroso matón profesional con amplio conocimiento militar. De este modo, Beckett se verá obligada a enfrentarse de nuevo al caso de su madre. Será una nueva ocasión para conseguir que el asesino por fin cumpla condena. Pero tanto Kate como sus compañeros deberán tener más cuidado que nunca puesto que tendrán que adentrarse en el peligroso mundo de las bandas callejeras, enfrenarse a importantes traficantes de drogas y a sicarios sin escrúpulos. Además Kate, al reabrir el caso del asesinato de su madre, contactará con su padre para ponerle al tanto de la situación.

Castle y Beckett investigan el misterioso asesinato de un hombre cuyo cadáver encuentra una familia en su casa a la vuelta de sus de vacaciones. La víctima era completamente desconocida para la familia y todo apunta a que estuvo ocupando durante varios días la casa. Podría tratarse de una red de ocupas, que trabajan organizados para aprovecharse de las ausencia de los propietarios. Pronto descubrirán tenía la intención de realizar un atraco millonario. Por otra parte, se publica la lista anual de los solteros más guapos y cotizados de Nueva York. Y Castle un año más aparece como uno de los primeros de la lista. Pero además se informa de una posible relación entre el escritor y la agente de policía. Cuando ambos leen el artículo deciden desmentir el rumor. Para ello, Castle decide cenar con una de las solteras más deseadas de la ciudad y Kate quedará con un atractivo bombero amigo de Lanie. Pero la investigación del caso, provocará que la noche no termine como esperaban.

Castle y Beckett investigan el asesinato de una estrella del baseball que apareció muerta tras un viaje a Cuba. Según el agente de Vega, Bobby Fox, Alfredo Quintana es el culpable de la muerte de Vega. Quintana es presidente de una fundación Cubana que acusa al jugador de traicionar al pueblo cubano, después de que el deportista regresara de su reciente viaje a Cuba. Tras este viaje donde el jugador tuvo un encuentro con Fidel Castro, comenzó a ser criticado por estar de parte del régimen. La policía comienza a investigar a Quintana como sospechoso, pero pronto se desvelan varios secretos de la víctima que complicarán el caso. Lo primero que descubren es que el la víctima tras regresar de su isla natal contrató a un prestamista ilegal para que le dejara doscientos mil dólares. Además durante la investigación, Kate y Rick se encontrarán con toda una leyenda del baseball americano, Joe Torre, ex capitán del equipo de los Yankees. Por otra parte, Alexis tiene que trazar el árbol genealógico de su familia para el instituto, que no puede completar al no conocer la identidad de su abuelo paterno. Este trabajo hará que Castle vuelva a plantearse la identidad de su desconocido padre.

Basada en un hecho real ocurrido en 1850, narra la historia de Solomon Northup, un culto músico negro -y hombre libre- que vivía con su familia en Nueva York. Tras compartir una copa con dos desconocidos, Solomon descubre que ha sido drogado y secuestrado para ser vendido como esclavo en el Sur en una plantación de Louisiana. Renunciando a abandonar la esperanza, Solomon contempla cómo todos a su alrededor sucumben a la violencia, al abuso emocional y a la desesperanza. Entonces decide correr riesgos increíbles y confiar en la gente menos aparente para intentar recuperar su libertad y reunirse con su familia.

El equipo colabora con el equipo de respuesta internacional cuando uno de los suyos se ve envuelto en unos disturbios en México.

El equipo tiene que investigar el aumento sospechoso de accidentes de tráfico mortales.

Gibbs sigue obsesionado con la persona que mantuvo secuestrada a Kate y continúa preguntando constantemente a Ducky y a Kate cada detalle que puedan recordar sobre el criminal. Lo que Gibbs aún no sabe es que el terrorista tiene planeado derribar el helicóptero donde viaja el Presidente.

Un miembro del NCIS es asesinado y el equipo debe encontrar al responsable de tal retador crimen antes de que se cobren la vida de otro integrante: Gibbs. Durante esta investigación, una de las más complicadas a las que han tenido que hacer frente a lo largo de toda su carrera, el equipo trata de permanecer unido, una actitud totalmente contraria a los deseos de Vance, el asistente de dirección.

Tony comienza a sospechar que Ziva sabe algo más sobre el paradero de su amante, infiltrado de la Mossad, y no está siendo sincera con su equipo. Mientras, Gibbs y McGee continúan trabajando con la división del NCIS en Los Ángeles, aunque una misteriosa conexión entre la agente especial Macy y el jefe de la delegación en Washington podría salir a la luz y entorpecer la armonía entre los equipos.

Para pagar una deuda, un cazador de recompensas (The Rock) viaja a Helldorado, una ciudad en lo profundo de la jungla del Amazonas, para capturar a un convicto (Scott). Pero cuando llega, descubre que a quien tiene que detener es sólo un muchacho ávido de emociones que busca riqueza, y ambos formarán equipo para intentar encontrar una mina llena de oro.

Año 2145. Un escuadrón especial acude a la llamada de un laboratorio en el planeta Olduvai, donde al parecer unos siniestros mutantes están matando a la población tras un experimento fallido.