La tragedia se desarrolla cuando un avión, lleno de pasajeros, choca en una área remota cerca de Durango, Colorado. El equipo es reclutado para investigar y construir un perfil debido a las sospechosas circunstancias del suceso. Pronto se darán cuenta de que alguien, de cualquier forma, tomó el control del avión y cómo se ha hecho antes de que ocurra un caso similar. Este caso resuena mucho en Kate, quien recuerda un incidente trágico, por motivos familiares.

Después de realizar el perturbador descubrimiento en Atlanta del cuerpo de una víctima de asesinato cubierto de marcas de arañazos, al equipo se le pide investigar esto y otro asesinato posterior. Finalmente es deducido que esto puede estar conectado con un sudes delirante con un desorden de piel obsesivo.

El equipo viaja a San Diego para investigar un misterioso caso en el que es descubierto un chico, que había desaparecido el día de Halloween de un año antes, como otro niño que desaparece ese mismo día. El equipo discierne que deben trabajar con rapidez para evitar que el segundo niño experimente un horrible destino.

El equipo es llamado para investigar varios asesinatos de hombres jovenes en Missoula, Montana; sin embargo, no pueden encontrar ningún patrón entre las víctimas, además de la extraña manera en que fueron asesinados, por lo que es muy difícil para el equipo construir un perfil del sudes. Mientras tanto, JJ se enfrenta a sus sentimientos reprimidos sobre el trágico y prematuro suicidio de su hermana, que ocurrió cuando JJ era una niña pequeña.

Un coche con un periodista al volante se estrella a toda velocidad contra Ben y Semir, causando un accidente que acaba con la vida del reportero. Sus frenos habían sido manipulados y al visitar su oficina, se encuentran con que ha sido previamente registrada… ¿Qué estaría investigando para que alguien deseara matarle?

La fiscal del distrito es un verdadero incordio para la comisaría. Su último capricho es que su hija Heike-María se convierta en fiscal igual que ella, y para ello pide a Ben y Semir que la enseñen cómo es su día a día en la carretera. La muchacha hará por bueno el refrán «De tal palo tal astilla».

Programa musical que se emite de madrugada.

Espacio que recoge los mejores momentos y las imágenes más impactantes emitidas en las distintas cadenas de televisión.

Se produce el asesinato de un hombre cuyo cuerpo es encontrado arrastrado por la marea, Kono da con el lugar desde donde fue lanzado el cuerpo, que es una zona de lujo. Las cámaras de seguridad recogen que el hombre que mató al señor es el mismo que mató al padre de McGarrett, Victor Hesse.

Sam está convencido de que el robo de software para un nuevo vehículo aéreo no tripulado está relacionado con la desaparición de la hija de 10 años de edad del ingeniero jefe, una chica a la que Sam una vez proporcionó protección en Arabia Saudí.

Cuando una reportera de noticias anuncia al grupo responsable de la explosión mortal en un evento de caridad con patrocinio militar, el equipo debe investigar sus afirmaciones y buscar al atacante.

La familia Partney se prepara para abandonar el hotel en el que se encuentran de vacaciones cuando Brian –uno de los dos hijos del matrimonio- cae abatido por un disparo mientras ocupa el ascensor transparente del edificio. Cuando Horatio aparece en la escena del crimen encuentra junto al cadáver un pañuelo negro que la banda Cobra Familia utiliza a modo de “firma” en sus acciones. Tras analizar la cinta de seguridad del ascensor, los forenses ven en un reflejo el brazo del asesino, que viste una chaqueta igual a las de los empelados del hotel. Más tarde, la prenda aparece ensangrentada en la lavandería y es atribuida a un empleado llamado Luis Mendoza, que asegura no tener nada que ver con el asunto. Poco después hallan una llave en el bolsillo de la víctima que resulta ser de otra habitación: la de una atractiva joven a la que estuvo viendo durante su estancia, para enfado de Mitch, su novio. Entretanto, el hermano de Brian le cuenta a Horatio que pudo escuchar cómo una moto abandonaba el aparcamiento a toda velocidad. Los descubrimientos posteriores abocan a los C.S.I. a una trama relacionada con un ritual de iniciación en la banda Cobra Familia relacionada con los celos de Mitch, el novio despechado. Sin embargo, cuando la investigación está a punto de dar sus frutos, algunos de los miembros de la familia Partney deciden tomarse la justicia por su mano.

Calleigh se dirige a su coche tras tomar un refrigerio con unos amigos cuando otro vehículo se detiene a su lado y el conductor le apunta con una pistola. En un descuido, la agente logra sacar su arma y da el alto a los agresores, pero estos logran huir a toda velocidad. Cuando Calleigh sale del vehículo, advierte que sus atacantes han dado la vuelta y pretenden atropellarla. Ella dispara y el coche de los maleantes acaba estrellándose contra un escaparate. El conductor ha muerto, el copiloto ha huido y el cadáver de una mujer inocente queda en el suelo. Una vez comenzada la investigación de los hechos, Rick Steller acusa a Calleigh de comportamiento temerario, ya que la agente había estado bebiendo minutos antes del tiroteo. Mientras, la forense Alexx Woods descubre que la mujer murió en realidad antes del accidente y Horatio decide investigar en el colegio en el que trabajaba. Allí descubre que la víctima estaba tratando de parar a unos malhechores que vendían droga a los estudiantes y que fueron estos los que acabaron con su vida. Las pesquisas se centrarán entonces entorno al dueño de la tienda en la que todo ocurrió, el copiloto huido y un compañero de instituto de la fallecida, que parece saber más de lo que cuenta.

Red y Liz descubren que Andras Halmi, consejero de confianza de El Director, ha desaparecido. Durante la búsqueda de Halmi, ambos escapan por los pelos de una violenta confrontación.

Una tragedia familiar del pasado de Samar vuelve a salir a la luz cuando el equipo de fuerzas especiales va tras la búsqueda de un esquivo terrorista internacional. Mientras, el FBI y la Cábala ganan terreno en su búsqueda de Liz y Red.

Liz se separa de Reddington cuando él se ve involucrado en una peligrosa situación. Samar toma una decisión arriesgada para ayudar a Liz, y Tom y Cooper continúan su búsqueda por liberar a Liz de sus cargos.

El equipo es llamado a Tallahassee, Florida para buscar a un asesino en serie que hace llamadas telefónicas a las autoridades para avisar de los asesinatos que el mismo ha cometido. Mientras, cuando Rossi se prepara para la visita de fin de semana de su hija Joy, recibe noticias de la muerte de su mejor amigo y compañero de Vietnam, Harrison Scott.

El equipo reabre una investigación de un caso sin resolver que envuelve a un asesino que eludió a la justicia desde los años 70, en cuyo caso también trabajaron Rossi y Gideon cuando el equipo aún estaba en sus primeras etapas de desarrollo. Mientras tanto, los agentes tratan de llegar a un acuerdo con el asesinato de uno de los suyos.

Cuando una cafetería en Indianapolis explota en un bombardeo y un hombre que emerge de sus escombros es aclamado como héroe, el equipo pone en custodia a él y a su familia. Mientras, el equipo finalmente deduce que habrá más atentados y deben trabajar contra el reloj para encontrar a la persona o personas responsables y su motivo principal para evitar más víctimas.

El descubrimiento de víctimas de asesinatos en serie en Diamond Bar, California dirige el BAU a la búsqueda de un sujeto desconocido que puede haber sido testigo de un abuso profundo cuando era un niño. Mientras tanto, Kate está muy preocupada cuando su sobrina, Meg, queda con uno de sus amigos para reunirse con un niño a quien conocen sólo de internet.

El equipo debe encontrar a un loco que busca venganza antes de que pueda poner más bombas y matar a más personas. Matt, el hermano Danny está en la ciudad, pero la reunión familiar no es la razón.

El equipo peina una convención para encontrar al asesino de un fan de ciencia-ficción que fue arrojado por una ventana de gran altura. Un agente de la CIA está interesado en la Yakuza que mató a los padres McGarrett se encuentra en la ciudad para reunirse con Steve.

Cuando se sospecha que un agente del NCIS encubierto trabaja para el contrabandista que se supone que está investigando, el equipo lo pone bajo custodia para encontrar sus verdaderas intenciones. Mientras tanto, Kensi y Deeks discuten sobre su relación personal cuando Kensi regresa al campo.

Sam está convencido de que el robo de software para un nuevo vehículo aéreo no tripulado está relacionado con la desaparición de la hija de 10 años de edad del ingeniero jefe, una chica a la que Sam una vez proporcionó protección en Arabia Saudí.

Cuando el equipo se dirige a Nueva Orleans para localizar a la estafadora que se hace pasar por la esposa de \"Duke Jacoby\", uno de los viejos alias de Jack en la CIA, Jack se encuentra en peligro cuando los viejos enemigos de \"Duke\" resurgen buscando venganza.

Cuando uno de los asesinos de Murdoc acepta entregarle a cambio de 10 millones, el equipo se encuentra protegiendo a Murdoc de su antiguo mentor, Nicholas Helman, que lo quiere muerto. Además, Jack se da cuenta de que aún puede sentir algo por la madre de Riley, Diane.

Un maestro del disfraz al que MacGyver creía muerto hacía mucho tiempo, reaparece con planes de venganza, evocando una serie de recuerdos sobre cuando se encontraron por primera vez.

Mac y Jack intentan rescatar al hijo de un multimillonario después de que él es secuestrado por un ex SEAL de la Marina que usa un arma EMP para cortar la corriente eléctrica y las líneas de comunicación al rascacielos de Shanghai donde vive el niño.

Mientras MacGyver está en Puerto Rico ayudando a su amigo a reconstruir su casa dañada por el huracán, es tomado como rehén en el banco que su amigo dirige cuando los ladrones intentan robar 2 millones de dólares.

Mac y Riley son atacados por un grupo de hombres enmascarados después de que el gobierno los llame para examinar un misterioso objeto que se estrelló en el desierto de Nevada. Además, Riley descubre nueva información sobre el padre de Mac, pero se pregunta si se la entregará después de que él diga que necesita seguir adelante.

Mac encuentra a su padre, y de inmediato se ve arrastrado al caso de un cártel que está tratanto de fabricar una droga que mejore el rendimiento. Mientras, Wilt descubre que Leanna ha recibido una oferta de trabajo en Phoenix, y Riley considera un cambio de carrera.